En 1999 estalló la huelga contra el alza de cuotas en la UNAM. El entonces rector Francisco Barnés de Castro impuso el alza de cuotas en la UNAM, un pago por semestre de 1,360 pesos para bachillerato y 2,040 para licenciatura por alumno. El 15 de marzo el Consejo Universitario aprobó la reforma al Reglamento General de Pagos de la UNAM en menos de 3 minutos, en una sede externa y con más de 30 consejeros universitarios opositores ausentes. El 20 de abril de 1999 la mayoría de las escuelas fueron tomadas por estudiantes en rechazo al reglamento general de pagos. El 6 de febrero de 2000, 2 mil 600 elementos de la Policía Federal Preventiva tomaron Ciudad Universitaria y dejó un saldo de casi mil estudiantes detenidos y órdenes de aprehensión contra otros 500.